La genomica 3D fornisce un accesso senza precedenti alla sequenza, alla struttura e al panorama regolatorio di qualsiasi genoma. La tecnica Hi-C (High Throughput Chromatin Conformation Capture) che consente di evidenziare come cambiamenti temporali e spaziali nella cromatina alterano la regolazione genica e le funzioni cellulari, combina il saggio di Proximity Ligation con l’approccio NGS.
Questa tecnica è stata ottimizzata nei kit Arima Hi-C per ottenere un protocollo più flessibile, robusto e veloce che può essere fatto in un solo tubo utilizzando 2 o 4 enzimi di restrizione brevettati e producendo una percentuale di interazione long- range cis molto più alta rispetto all’approccio classico con un costo inferiore. Molteplici sono i campi di applicazione della genomica 3D. Nella ricerca sul cancro, permette la scoperta di varianti strutturali per una comprensione completa dei meccanismi delle malattie, la scoperta di biomarcatori e nuovi approcci terapeutici grazie agli approfondimenti sulla sequenza, struttura e panorama regolatorio dei genomi del cancro.
Capire come le relazioni spaziali nella struttura del genoma influenzino la regolazione genica, lo sviluppo cellulare e i processi patologici supporta invece gli studi di epigenetica, mentre l’assemblaggio di genomi su scala cromosomica aiuta a esplorare l’evoluzione delle specie.
